Protein–RNA interactions for Protein: Q8R349

Cdc16, Cell division cycle protein 16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc16Q8R349 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cdc16Q8R349 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms