Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mtmr3Q8K296 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Mtmr3Q8K296 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms