Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGV2

Tph2, Tryptophan 5-hydroxylase 2, mousemouse

Predictions only

Length 488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tph2Q8CGV2 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tph2Q8CGV2 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tph2Q8CGV2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tph2Q8CGV2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tph2Q8CGV2 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms