Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD94

Lin52, Protein lin-52 homolog, mousemouse

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Length 116 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin52Q8CD94 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Lin52Q8CD94 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Lin52Q8CD94 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms