Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD60

UPF0583 protein C15orf59 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8CD60 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q8CD60 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q8CD60 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q8CD60 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q8CD60 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms