Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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