Protein–RNA interactions for Protein: Q8C3L1

Ssuh2, Protein SSUH2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssuh2Q8C3L1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ssuh2Q8C3L1 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Cisd3-201ENSMUST00000107583 737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ssuh2Q8C3L1 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms