Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx16Q8C080 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Snx16Q8C080 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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