Protein–RNA interactions for Protein: Q8BV16

Zfp398, Zinc finger protein 398, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp398Q8BV16 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Zfp398Q8BV16 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Zfp398Q8BV16 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms