Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pggt1bQ8BUY9 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pggt1bQ8BUY9 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pggt1bQ8BUY9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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