Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMD6

Tmem260, Transmembrane protein 260, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem260Q8BMD6 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem260Q8BMD6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms