Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc4Q8BKW4 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms