Protein–RNA interactions for Protein: Q80VQ1

Lrrc1, Leucine-rich repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc1Q80VQ1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrrc1Q80VQ1 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lrrc1Q80VQ1 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68 ms