Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF1

Dsg1b, Desmoglein-1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1bQ7TSF1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Dsg1bQ7TSF1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Dsg1bQ7TSF1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms