Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Scn4bQ7M729 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Scn4bQ7M729 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms