Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
ScocQ78YZ6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
ScocQ78YZ6 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
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