Protein–RNA interactions for Protein: Q78IS1

Tmed3, Transmembrane emp24 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed3Q78IS1 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tsn-201ENSMUST00000027623 7063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Tmed3Q78IS1 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms