Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFE7

Tmeff1, Tomoregulin-1, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmeff1Q6PFE7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Tmeff1Q6PFE7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Tmeff1Q6PFE7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms