Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A1

Stmnd1, Stathmin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stmnd1Q6P3A1 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Stmnd1Q6P3A1 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Stmnd1Q6P3A1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms