Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Tpm4Q6IRU2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Tpm4Q6IRU2 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms