Protein–RNA interactions for Protein: Q6EDY6

Carmil1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Carmil1Q6EDY6 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Carmil1Q6EDY6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Carmil1Q6EDY6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms