Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZI1

Sh3rf1, E3 ubiquitin-protein ligase SH3RF1, mousemouse

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Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3rf1Q69ZI1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sh3rf1Q69ZI1 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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