Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Zfp248Q640N4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Zfp248Q640N4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms