Protein–RNA interactions for Protein: Q62465

Vat1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vat1Q62465 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vat1Q62465 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vat1Q62465 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms