Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SnrpaQ62189 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms