Protein–RNA interactions for Protein: Q62181

Sema3c, Semaphorin-3C, mousemouse

Predictions only

Length 751 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3cQ62181 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sema3cQ62181 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema3cQ62181 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms