Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rbbp4Q60972 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms