Protein–RNA interactions for Protein: Q60750

Epha1, Ephrin type-A receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha1Q60750 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Epha1Q60750 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Epha1Q60750 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms