Protein–RNA interactions for Protein: Q60668

Hnrnpd, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein D0, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HnrnpdQ60668 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HnrnpdQ60668 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
HnrnpdQ60668 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms