Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clca4bQ3UW98 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clca4bQ3UW98 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms