Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdgfl2Q3UMU9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdgfl2Q3UMU9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms