Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 4930417O13Rik-204ENSMUST00000205000 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
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Gtpbp6Q3U6U5 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Gtpbp6Q3U6U5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms