Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmem35bQ3U0Y2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms