Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Tmem248Q3TBN1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Tmem248Q3TBN1 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms