Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR2

Pdss1, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 1, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss1Q33DR2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pdss1Q33DR2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms