Protein–RNA interactions for Protein: Q2TV84

Trpm1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm1Q2TV84 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm1Q2TV84 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm1Q2TV84 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms