Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Traf3ip1Q149C2 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Traf3ip1Q149C2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
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