Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
MKRN3Q13064 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
MKRN3Q13064 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
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