Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBP7

Shisal1, Protein shisa-like-1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisal1Q0VBP7 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Shisal1Q0VBP7 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Shisal1Q0VBP7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms