Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Sox9Q04887 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Sox9Q04887 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms