Protein–RNA interactions for Protein: Q03402

Crisp3, Cysteine-rich secretory protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crisp3Q03402 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Crisp3Q03402 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Crisp3Q03402 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms