Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cbx1P83917 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cbx1P83917 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms