Protein–RNA interactions for Protein: P82348

Sgcg, Gamma-sarcoglycan, mousemouse

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgcgP82348 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SgcgP82348 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SgcgP82348 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SgcgP82348 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms