Protein–RNA interactions for Protein: P81066

Irx2, Iroquois-class homeodomain protein IRX-2, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx2P81066 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irx2P81066 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irx2P81066 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms