Protein–RNA interactions for Protein: P70196

Traf6, TNF receptor-associated factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf6P70196 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Traf6P70196 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Traf6P70196 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87 ms