Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
P58686 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
P58686 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
P58686 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
P58686 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms