Protein–RNA interactions for Protein: P58389

Ptpa, Serine/threonine-protein phosphatase 2A activator, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpaP58389 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
PtpaP58389 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PtpaP58389 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms