Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Samsn1P57725 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Samsn1P57725 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms