Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CartptP56388 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
CartptP56388 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CartptP56388 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CartptP56388 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CartptP56388 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CartptP56388 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CartptP56388 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms