Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pex2P55098 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pex2P55098 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms